Řídícím a koncepčním orgánem Grantové agentury je Vědecká rada GA (dále jen Rada GA) navrhovaná z řad významných akademických a vědeckých pracovníků, případně významných odborníků z praxe. Členy rady jmenuje a odvolává Správní rada Nadačního fondu podnikavostí k prosperitě. Činnost Rady Grantové agentury řídí její předseda. Funkční období Rady Grantové agentury je čtyřleté. Členství v Radě Grantové agentury zaniká uplynutím funkčního období, rezignací člena, ukončením pracovního poměru nebo odvoláním z jiných důvodů.
Administrativní a technické záležitosti jsou v kompetenci tajemníka Rady Grantové agentury.
Rada Grantové agentury vyhlašuje grantové schéma včetně konkretizace zaměření pro daný rok, stanovuje termíny pro podávání grantových žádostí, určuje oponenty pro posuzování grantových žádostí z řád členů Oborových komisí a externích odborníků v dané vědecké oblasti, připravuje a schvaluje seznam grantových žádostí doporučených k financování, na základě hodnocení Oborové komise posuzuje kvalitu řešení projektu a dále roční zprávu o své činnosti. Termín pro kontrolu kvality řešení jednotlivých projektů a zpracování roční zprávy o činnosti Rady Grantové agentury je 15. 2. běžného kalendářního roku následující po roce realizace projektu.
Členové rady Grantové agentury Academia aurea:
Předseda:
Členové: